陈华清同志(党委书记、主任)主持党委、行政全面工作。分管办公室、政治处(人事处)、财务处、港航运行处。
林登松同志(党委委员、纪委书记)负责党风廉政建设、纪检监察、审计等工作。分管监察审计处,联系泉州湾港务站、围头湾港务站。
肖富同志(党委委员、副主任)负责港航规划建设、交通战备、生产安全、应急、环保、信息化、引航等工作。分管规划建设处、安全监督处、科技信息处,联系泉州港口管理行政执法支队、航道管理站、水运工程质量安全技术站、引航站。
除上述分工外,中心领导还承担各自分管领域党风廉政、意识形态、综治、安全、信访、保密、环保等工作。