承担全省水运工程基础设施建设及质量行业管理的事务性工作。按有关规定负责水运工程建设项目初步设计、竣工验收等审核审批的技术性审查工作；承担水运交通建设项目履行基本建设程序和市场监管的事务性工作，组织开展全省水运建设市场信用体系建设。参与世亚行(或国际金融组织)贷款项目的全过程管理的事务性工作。参与水运工程建设项目中重大技术问题的审核和建设工程中重大问题的协调；承担水路交通行业内交通战备和国防动员等事务性工作。承担全省水运交通基础设施维护行业管理的事务性工作；负责航道通航条件影响评价审核、沿海港口码头靠泊能力核定等的技术性审查工作；协助处理水资源综合利用中与航道有关事宜。